摘要：為分析感染水霉菌對巨須裂腹魚脾臟轉(zhuǎn)錄組的影響，探索水霉菌感染巨須裂腹魚的分子機制，實驗隨機選取生活在同一水域中的5尾健康和5尾感染水霉菌的巨須裂腹魚，采用PDA瓊脂培養(yǎng)基和分子生物學方法對巨須裂腹魚水霉菌進行分離鑒定，并采用Illumina HiSeqTM 2000高通量測序平臺，對健康和感染水霉菌的巨須裂腹魚脾臟組織進行轉(zhuǎn)錄組測序，并對測序數(shù)據(jù)進行拼接、注釋和差異表達基因分析。結(jié)果顯示，從巨須裂腹魚皮膚上分離鑒定得到3株水霉菌；轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示，健康組和感染水霉病組分別獲得46 619 504條和43 912 876條數(shù)據(jù)，與健康組相比，感染水霉菌組共有1 889個基因發(fā)生差異表達，其中1 414個基因上調(diào)，475個基因下調(diào)，隨機選取6個差異表達基因進行實時熒光定量PCR (RT-qPCR)驗證，驗證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序一致。對健康組和感染水霉菌組的差異表達基因進行GO功能富集發(fā)現(xiàn)，上調(diào)基因主要富集于241個功能中，下調(diào)基因主要富集于60個功能中，上述基因主要涉及分子功能類、細胞組分類和生物過程類等生理功能；KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn)，差異表達基因主要富集在免疫疾病、內(nèi)分泌和代謝疾病、病毒感染性疾病、消化系統(tǒng)及排泄系統(tǒng)等。研究表明，感染水霉菌會影響巨須裂腹魚脾臟組織多種基因的表達量，實驗結(jié)果為進一步探索巨須裂腹魚水霉菌的感染機制奠定了基礎。
